41位～50位
41位：やわらかあたま塾（任天堂）：164万本出荷（158万本販売）
【ジャンル：その他】2005年発売 ／ ニンテンドーDS
42位：キングダム ハーツ（スクウェア）：160万本出荷（95万本販売）
【ジャンル：アクションRPG】2002年発売 ／ PlayStation2（プレイステーション2）
43位：ドラゴンクエストモンスターズ ジョーカー（スクウェア・エニックス）：160万本出荷（154万本販売）
【ジャンル：RPG】2006年発売 ／ ニンテンドーDS
44位：キングダム ハーツII（スクウェア・エニックス）：160万本出荷（112万本販売）
【ジャンル：アクションRPG】2005年発売 ／ PlayStation 2（プレイステーション2）
45位：ポケモン不思議のダンジョン 時の探検隊・闇の探検隊（ポケモン）：158万本出荷（155万本販売）
【ジャンル：RPG】2007年発売 ／ ニンテンドーDS
46位：マリオパーティ8（任天堂）：156万本出荷（147万本販売）
【ジャンル：その他】2007年発売 ／ Wii
47位：大乱闘スマッシュブラザーズDX（任天堂）：151万本出荷（134万本販売）
【ジャンル：アクション】2001年発売 ／ ニンテンドーゲームキューブ
48位：ドラゴンクエストモンスターズ2 マルタのふしぎな鍵（エニックス）：150万本出荷（150万本販売）
【ジャンル：RPG】2001年発売 ／ ゲームボーイ・カラー共通
49位：ドラゴンクエストV 天空の花嫁 DS版（スクウェア・エニックス）：140万本出荷（130万本販売）
【ジャンル：RPG】2008年発売 ／ ニンテンドーDS
50位：街へいこうよ どうぶつの森（任天堂）：139万本出荷（126万本販売）
【ジャンル：その他】2008年発売 ／ Wii
